KLF6

KLF6
Tunnisteet
Aliakset	KLF6, BCD1, CBA1, COPEB, CPBP, GBF, PAC1, ST12, ZF9, Kruppel-like factor 6, Kruppel like factor 6
Muut tunnisteet	OMIM: 602053; MGI: 1346318; HomoloGene: 996; GeneCards: KLF6; OMA:KLF6 - orthologs
Geenisijainti (Ihminen)
Kromosomi	Kromosomi 10 (ihminen)
Loppu	3,785,281 bp
Geenisijainti (Hiiri)
Kromosomi	Kromosomi 13 (hiiri)
Loppu	5,920,393 bp
RNA-ilmenemisen kaava
	Top expressed in
	nänni; ; lower lobe of lung; ; skin of thigh; ; saphenous vein; ; onttolaskimot; ; perikardium; ; gastric mucosa; ; skin of hip; ; monosyytti; ; synovial joint;
	Top expressed in
	jyvässolu; ; stroma of bone marrow; ; aorttaläppä; ; nouseva aortta; ; Lonkkahermo; ; endothelial cell of lymphatic vessel; ; left colon; ; tunica media of zone of aorta; ; right lung lobe; ; veri;
	Lisää ilmenemistietoa
	; ; ; ;
	Lisää ilmenemistietoa
Geenin ontologia
Molekulaarinen toiminto	DNA binding; Proteiinisitoutuminen plasmassa; metal ion binding; nucleic acid binding; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; double-stranded DNA binding;
Solukomponentti	fibrillar center; tuma; Tumajyvänen; sytosoli; intracellular membrane-bounded organelle;
Biologinen prosessi	positive regulation of transcription, DNA-templated; B cell differentiation; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; positive regulation of transcription by RNA polymerase II; transcription by RNA polymerase II; regulation of transcription by RNA polymerase II; cytokine-mediated signaling pathway;
	Lähteet:Amigo / QuickGO
Ortologia
	1316
	23849
	ENSG00000067082
	ENSMUSG00000000078
	Q99612
	O08584; Q8BPQ2
	NM_001008490; NM_001160124; NM_001160125; NM_001300
	NM_011803
	NP_001153596; NP_001153597; NP_001291
	NP_035933
	Wikidata
Ihminen Wikidatassa	Hiiri Wikidatassa

KLF6 (engl. Krupper-like factor 6) on ihmisen geeni. Se sijaitsee kromosomin 10 lyhyessä varressa asemassa 10p15.1. Se koostuu 9268 nukleotidi- eli emäsparista ja se sisältää 4 eksonia, joiden pituudet ovat 218, 574, 124 ja 525 emäsparia.

KLF6-geeni koodaa tuman transkriptiotekijäproteiinia, jonka nimi on yhtäläinen geenin nimen kanssa eli Krupper-like factor 6 (KLF6). Krupper-like factor -proteiinit ovat ryhmä transkriptiotekijöitä eli proteiineja, jotka säätelevät geenien ekspressiota eli ilmenemistä soluissa. KLF-proteiineilla on osoitettu olevan vaikutusta eri biologisiin prosesseihin mukaan lukien karsinogeneesi eli syövän syntyminen. KLF6-proteiinilla on kolme sinkkisormea C-terminaalialueen päädyssä, runsaasti seriiniä ja treoniinia sisältävä keskialue ja hapan alue N-terminaalialueella. Tämän proteiinin sinkkisormet sitoutuvat spesifisesti DNA:n runsaasti guaniinia sisältäviin promoottorialueisiin. Keskialue voi mahdollisesti liittyä proteiinin aktivaatioon tai posttranslationaalisiin säätelyteihin ja hapan N-terminaali voi mahdollisesti olla tärkeä transkriptionaalisessa aktivaatiossa.

KLF6-geenin on todettu mutatoituneen monissa eri kasvaimissa eli tuumoreissa, muun muassa joissakin eturauhassyöpätapauksissa. Usein mutaatioon on liittynyt KLF6-geenin toisen alleelin menetys eli heterotsygotian menetys (engl. Loss of heterozygosity). KLF6-geeni on tuumorisuppressorigeeni, koska sen koodaama KLF6-proteiini kykenee hillitsemään solujen kasvua ja lisääntymistä. KLF6-proteiini muun muassa aktivoi p21-geenin promoottoria aiheuttaen solusyklin säätelijäproteiini p21:n yliekspression, mikä pysäyttää solusyklin p53-proteiinista riippumattomasti. Tuumoreissa esiintyvät mutatoituneet KLF6-proteiinit eivät kykene toimimaan tuumorisuppressoreina.

Lähteet

Ceshi C, Hyytinen E-R, Xiaodong S, Helin H, Koivisto P, Frierson H, Vessella R, Dong J-T: Deletion, Mutation, and Loss of Expression of KLF6 in Human Prostate Cancer. American Journal of Pathology, 2003, 162. vsk, nro 4, s. 1349–1354. Artikkelin verkkoversio. (pdf) Viitattu 23.4.2008. (englanti)^{[vanhentunut linkki]}
Narla G et al.: KLF6, a Candidate Tumor Suppressor Gene Mutated in Prostate Cancer. Science, 2001, 294. vsk, nro 5551, s. 2563–2566. Artikkelin verkkoversio. Viitattu 23.4.2008. (englanti)

Aiheesta muualla

http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=KLF6

1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000067082 – Ensembl, May 2017
1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000078 – Ensembl, May 2017
↑ Human PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.
↑ Mouse PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.

[refGRCh38Ensembl-1] 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000067082 – Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000078 – Ensembl, May 2017

[3] Human PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.

[4] Mouse PubMed Reference: ncbi.nlm.nih.gov.

[1]

[2]

[3]

[4]