【卒論・修論・博論】論文が30分で完成する？｜Obsidian × Claude Code × GitHubでつくるAI研究自動化システム｜（Mac/Windows対応・コード全文）

朝、Obsidianを開くと、昨日までに発表された関連論文が要旨つきで並んでいる。
AIがそれを「読むべき順」に仕分けし、先行研究レビューの下書きをつくってくれる。
材料が揃えば、論文の初稿まで一緒に書き進められる。

この記事では、そんな研究環境を自分のパソコンとGitHubだけで構築する手順を、コードと設定ファイルをすべて掲載して解説します。

この記事で手に入るもの

• 毎日自動で関連文献を検索・保存するPythonコード全文

• GitHub Actionsの設定ファイル全文

• AIに研究上のルールを守らせる設定ファイル（CLAUDE.md）のテンプレート

• 「文献の仕分け」「先行研究レビュー」「RQ検討」「論文初稿」の4つのAIコマンド

• Mac・Windowsそれぞれの手順と、つまずきやすいエラーの対処法

こんな人に向いています

• 卒論・修論・博論、研究計画書のために先行研究を継続的に追いたい

• 文献管理がExcelやメモアプリに散らばっている

• AIを研究に使いたいが、「嘘の文献」や研究倫理が心配

• プログラミング経験はないが、手順どおりに進めることはできる

必要なもの・費用・所要時間

• パソコン：Mac（macOS 13以降）またはWindows 10/11

• Obsidian：無料

• GitHub：無料プランで可（Privateリポジトリも可）

• OpenAlex：無料（無料APIキーを取得します）

• Claude Code：Claudeの有料プラン（Pro以上）またはAPI契約が必要。無料プランでは使えません

• 所要時間：初回構築でおよそ60〜90分

※料金・プラン条件は変わることがあります。購入前に各公式サイトでご確認ください。

第1章 「論文が30分で完成する」の本当の意味

先に、誤解のないようにお伝えします。AIを使っても、研究テーマの設定、調査や実験、分析、論文提出までを30分で終えることはできません。

この記事が目指すのは、研究に必要な材料がObsidianに揃っている状態から、論文の初稿を短時間でつくれることです。

例えば、次の情報が整理されているとします。

• 研究目的とリサーチクエスチョン

• 精読・確認済みの先行研究

• 研究方法

• 調査・実験データと、検証済みの分析結果

• 考察のメモ

ここまで揃っていれば、Claude Codeに構成案と各章の初稿をつくらせることができます。「30分」はその作業の目標時間です（実測値や品質を保証するものではありません）。

逆に言えば、時間がかかるのは「材料を揃えること」です。だからこの記事では、材料が毎日自然に貯まっていく仕組みから作ります。

AIに研究を丸投げするのではなく、AIに反復作業を任せて、考えるべき問いに時間を使う。そのための環境です。

第2章 完成する研究環境の全体像

例として、研究テーマは「睡眠と学習の関係」にします（あとで自分のテーマに変更します）。

完成後は、毎日次の流れで動きます。

【自動】
① 毎朝7時ごろ、GitHub Actionsがプログラムを起動する
② 学術データベースOpenAlexで、登録したキーワードに合う直近の論文を検索する
③ タイトル・著者・掲載誌・DOI・要旨をMarkdownファイルとして保存する（重複は自動で除外）

【自分のタイミングで】
④ Obsidianで新着文献を確認する
⑤ Claude Codeに「仕分け」を頼み、読むべき論文を決める
⑥ 読んだ論文をもとに、先行研究レビューやRQ、論文初稿の草稿をつくる

フォルダ構成は最終的にこうなります。

research-automation/
├─ 01_Literature/      ← 自動収集された文献ノート（1論文1ファイル）
├─ 02_Daily_Review/    ← 日ごとの収集レポート
├─ 03_Project/         ← 研究計画・方法・データ・考察メモ（自分で書く）
├─ 04_Drafts/          ← AIがつくった草稿の保存先
├─ scripts/collect.py  ← 文献収集プログラム
├─ .github/workflows/daily.yml ← 毎日の自動実行設定
├─ .claude/skills/     ← AIコマンド
└─ CLAUDE.md           ← AIに守らせる研究ルール

なお、「毎日検索する」ことは「毎日必ず新しい論文が見つかる」ことを意味しません。データベースの収録状況や検索条件によって結果は変わります。

次章から、実際に構築していきます

第3章 STEP 1｜Obsidianをインストールする

Obsidianの公式サイトからアプリをダウンロードし、インストールします。
https://obsidian.md/

Obsidianでは、ノートを保存するフォルダを「保管庫（Vault）」と呼びます。

ここではまだ保管庫を作らなくて構いません。後ほどGitHubから取得するフォルダを、そのまま保管庫として開くためです。

すでにObsidianを使っている人も、今回は既存のノートと混ぜず、新しい保管庫を使ってください。

※後で使うプラグイン「Claudian」はObsidian 1.13.0以降が必要です。古いバージョンを使っている人は、アップデートしておきましょう。

第4章 STEP 2｜GitとGitHubを準備する

Claude Codeより先に、Gitを準備します（WindowsではClaude CodeがGitに含まれる「Git Bash」を使うため）。

GitHubアカウントを作る

アカウントがない人は作成してください。
https://github.com/

Gitをインストールする

Macの場合
「Command + スペース」で「ターミナル」と検索して起動し、次を実行します。

git --version

バージョンが表示されれば準備完了です。表示されず「開発者ツールをインストールしますか？」と出た場合は、案内に従ってインストールしてください。

Windowsの場合
Git for Windowsを公式サイトからインストールします（設定はすべて初期値のままで構いません）。
https://git-scm.com/downloads/win

インストール後、スタートメニューから「PowerShell」を起動し、次を実行します。

git --version

最初に1回だけ、名前とメールを登録する

Mac・Windows共通で、次の2行を実行します（自分の名前とGitHubに登録したメールアドレスに置き換えてください）。

git config --global user.name "あなたの名前"
git config --global user.email "あなたのメールアドレス"

これをしないと、後で自分のメモを保存（コミット）するときにエラーになります。

第5章 STEP 3｜Claude Codeをインストールしてログインする

Claude Codeは、AIがファイルを読み書きしながら作業を手伝ってくれるツールです。

Mac（ターミナル）

curl -fsSL https://claude.ai/install.sh | bash

Windows（PowerShell）

irm https://claude.ai/install.ps1 | iex

インストールが終わったら、ターミナル（PowerShell）をいったん閉じて開き直し、次を実行します。

claude --version

バージョン番号が表示されれば成功です。「claudeが見つからない」と出た場合は、第18章のQ1を参照してください。

続けて、次を実行してログインします。

claude

ブラウザが開くので、Claudeのアカウントでログインしてください。Claude Codeの利用にはPro以上の有料プランまたはAPI契約が必要です。

※公式のインストールスクリプトを実行します。最新の手順は公式ドキュメントで確認してください。
https://code.claude.com/docs/

第6章 STEP 4｜ObsidianにClaudianを導入する

ClaudianはObsidianの中でClaude Codeを使えるようにするコミュニティプラグインです。

1. Obsidianの「設定」を開く

2. 「コミュニティプラグイン」を開き、制限モードをオフにする

3. 「閲覧」を押して「Claudian」と検索する

4. インストールして「有効化」する

Claude Codeを認識させる

基本的には自動で検出されます。検出されない場合は、Claude Codeの場所を手動で指定します。

Mac（ターミナル）

which claude

Windows（PowerShell）

where.exe claude

表示されたパスを、Claudianの「設定 → Claudian → Providers → Claude Code」の欄に入力します。

• Windowsでは、claude.exe で終わるパスを指定します（.cmd や .ps1 は指定しない）

• 設定を変えたら、Obsidianを再起動します

• 設定画面の名称はバージョンによって変わることがあります。見当たらない場合は公式READMEを確認してください
  https://github.com/YishenTu/claudian

動作確認

Claudianのチャットを開いて、次のように入力します。

返事が返ってくれば連携は完了です。

※Claudianを通じて、保管庫内のノートがAIに送られます。機密資料や個人情報を含む保管庫では使わないでください（第19章で詳しく説明します）。

第7章 STEP 5｜GitHubに研究用リポジトリを作る

GitHubにログインし、右上の「＋」→「New repository」を選びます。

• Repository name：research-automation

• 公開範囲：Private

• 「Add a README file」にチェック

で作成します。

Privateにしても、未公開の個人情報や研究協力者のデータはこのリポジトリに入れないでください。

第8章 STEP 6｜文献収集プログラムを作る

ここが心臓部です。Pythonの知識は不要です。コードをコピーして貼り付けるだけで動きます。

1. リポジトリの画面で「Add file」→「Create new file」

2. ファイル名に scripts/collect.py と入力（スラッシュを入れるとフォルダが自動でできます）

3. 次のコードを貼り付けて「Commit changes」