ข้ามไปเนื้อหา

Aquificota

จากวิกิพีเดีย สารานุกรมเสรี

Aquificota
การจำแนกชั้นทางวิทยาศาสตร์ แก้ไขการจำแนกนี้
โดเมน: แบคทีเรีย
Bacteria
อาณาจักร: Pseudomonadati
ไฟลัม: Aquificota
Reysenbach 2021[1]
ชั้น
ชื่อพ้อง
  • "Aquificae" Reysenbach 2001
  • "Aquithermota" Cavalier-Smith 2020
  • "Aquificota" Whitman et al. 2018
  • "Aquificaeota" Oren et al. 2015

ไฟลัม Aquificota เป็นกลุ่มแบคทีเรียที่มีความหลากหลายซึ่งอาศัยอยู่ในสภาพแวดล้อมที่รุนแรง[2][3] ชื่อ Aquificota ได้รับการตั้งให้กับไฟลัมนี้ โดยอิงจากสกุลแรก ๆ ที่ระบุภายในกลุ่มนี้ คือ Aquifex (“ผู้สร้างน้ำ”) ซึ่งสามารถผลิตน้ำได้โดยการออกซิไดซ์ไฮโดรเจน[4] พบได้ในน้ำพุ สระน้ำ และมหาสมุทร พวกมันเป็นสิ่งมีชีวิตสร้างอาหารเองได้ และเป็นผู้ตรึงคาร์บอนหลักในสภาพแวดล้อมของพวกมัน แบคทีเรียเหล่านี้เป็นแบคทีเรียแกรมลบรูปแท่งที่ไม่สร้างสปอร์[5] ถือเป็นแบคทีเรียแท้ (โดเมนแบคทีเรีย) ซึ่งแตกต่างจากสิ่งมีชีวิตอื่น ๆ ที่อาศัยอยู่ในสภาพแวดล้อมสุดขั้วอย่างอาร์เคีย

อนุกรมวิธาน

[แก้]

ปัจจุบัน Aquificota มี 15 สกุล และ 42 ชนิดพันธุ์ที่ได้รับการตีพิมพ์อย่างถูกต้อง[6] ไฟลัมนี้แบ่งออกเป็นสามชั้น แต่ละชั้นมีอันดับเป็นของตนเอง[7][8] Aquificales ประกอบด้วยวงศ์ Aquificaceae และ Hydrogenothermaceae ส่วน Desulfurobacteriaceae เป็นเพียงวงศ์เดียวใน Desulfurobacteriales และ Thermosulfidibacter takaii ไม่ได้ถูกจัดให้อยู่ในวงศ์ใดวงศ์หนึ่งภายในไฟลัม โดยพิจารณาจากความแตกต่างทางด้านวิวัฒนาการจากทั้งสองอันดับ[9] ปัจจุบันจัดอยู่ในกลุ่ม Aquificales แต่พบว่ามีลักษณะทางสรีรวิทยาคล้ายคลึงกับ Desulfobacteriaceae มากกว่า

วิวัฒนาการชาติพันธุ์

[แก้]

อนุกรมวิธานที่ได้รับการรับรองในปัจจุบันอิงจาก List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[10] และ National Center for Biotechnology Information (NCBI).[11][12]

16S rRNA อิงจาก LTP_10_2024[13][14][15] เครื่องหมายระบุโปรตีน 120 อันอิงจาก GTDB 10-RS226[16][17][18]
Thermosulfidibacterales

Thermosulfidibacteraceae

Thermosulfidibacterota
Thermosulfidibacteria
Thermosulfidibacterales

Thermosulfidibacteraceae Chuvochina et al. 2024

Aquificota
Aquificia
Desulfurobacteriales

Desulfurobacteriaceae L'Haridon et al. 2006

Aquificales

Hydrogenothermaceae Eder and Huber 2003

Aquificaceae Reysenbach 2002

อ้างอิง

[แก้]
  1. ↑ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987. S2CID 239887308.
  2. ↑ Griffiths E, Gupta RS (มกราคม 2006). "Molecular signatures in protein sequences that are characteristics of the phylum Aquificae". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56 (Pt 1): 99–107. doi:10.1099/ijs.0.63927-0. PMID 16403873.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  3. ↑ Horiike T, Miyata D, Hamada K, และคณะ (มกราคม 2009). "Phylogenetic construction of 17 bacterial phyla by new method and carefully selected orthologs". Gene. 429 (1–2): 59–64. doi:10.1016/j.gene.2008.10.006. PMC 2648810. PMID 19000750.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  4. ↑ Huber R, Wilharm T, Huber D, Trincone A, Burggaf S, Konig H, Reinhard R, Rockinger I, Fricke H, Stetter K (1992). "Aquifex pyrophilus gen. nov. sp. nov., Represents a Novel Group of Marine Hyperthermophilic Hydrogen-Oxidizing Bacteria". Syst. Appl. Microbiol. 15 (3): 340–351. doi:10.1016/S0723-2020(11)80206-7.
  5. ↑ L'Haridon, Reysenbach AL, Tindall BJ, Schönheit P, Banta A, Johnsen U, Schumann P, Gambacorta A, Stackebrandt E, Jeanthon C (ธันวาคม 2006). "Desulfurobacterium atlanticum sp. nov., Desulfurobacterium pacificum sp. nov. and Thermovibrio guaymasensis sp. nov., three thermophilic members of the Desulfurobacteriaceae fam. nov., a deep branching lineage within the bacteria" (PDF). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56 (Pt 12): 2843–2852. doi:10.1099/ijs.0.63994-0. PMID 17158986.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  6. ↑ J.P. Euzéby. "Aquificae". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). ข้อมูลเก่าจากต้นฉบับ เมื่อ 2011-06-13. สืบค้นเมื่อ 2016-09-09.
  7. ↑ Oren A, Garrity GM (2015). "List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 65 (7): 2017–2025. doi:10.1099/ijs.0.000317. PMC 5817221. PMID 28891789.
  8. ↑ Gupta RS, Lali R (กันยายน 2013). "Molecular signatures for the phylum Aquificae and its different clades: Proposal for division of the phylum Aquificae into the emended order Aquificales, containing the families Aquificaceae and Hydrogenothermaceae, and a new order Desulfurobacteriales ord. nov., containing the family Desulfurobacteriaceae". Antonie van Leeuwenhoek. 104 (3): 349–368. doi:10.1007/s10482-013-9957-6. PMID 23812969. S2CID 559778.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  9. ↑ Nunoura T, Oida H, Miyazaki M, Suzuki Y (มีนาคม 2008). "Thermosulfidibacter takaii gen. nov., sp. nov., a thermophilic, hydrogen-oxidizing, sulfur-reducing chemolithoautotroph isolated from a deep-sea hydrothermal field in the Southern Okinawa Trough". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 58 (Pt 3): 659–665. doi:10.1099/ijs.0.65349-0. PMID 18319474.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  10. ↑ Aquificota in LPSN; Freese, H. M.; Meier-Kolthoff, J. P.; Sardà Carbasse, J.; Afolayan, A. O.; Göker, M. (29 ตุลาคม 2025). "TYGS and LPSN in 2025: a Global Core Biodata Resource for genome-based classification and nomenclature of prokaryotes within DSMZ Digital Diversity". Nucleic Acids Research. 53: D1–D12. doi:10.1093/nar/gkaf1110.{{cite journal}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  11. ↑ Schoch CL; และคณะ. "Aquificota". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. สืบค้นเมื่อ 2025-06-05.
  12. ↑ Ludwig, W.; Euzéby, J. & Whitman W.B. (2008). "Bergey's Taxonomic Outlines: Volume 4 - Draft Taxonomic Outline of the Bacteroidetes, Planctomycetes, Chlamydiae, Spirochaetes, Fibrobacteres, Fusobacteria, Acidobacteria, Verrucomicrobia, Dictyoglomi, and Gemmatimonadetes" (PDF). Bergey's Manual Trust: 15. ข้อมูลเก่าจากต้นฉบับ (PDF) เมื่อ 2009-04-24. สืบค้นเมื่อ 2011-06-27.
  13. ↑ "The LTP". สืบค้นเมื่อ 10 ธันวาคม 2024.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  14. ↑ "LTP_all tree in newick format". สืบค้นเมื่อ 10 ธันวาคม 2024.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  15. ↑ "LTP_10_2024 Release Notes" (PDF). สืบค้นเมื่อ 10 ธันวาคม 2024.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  16. ↑ "GTDB release 10-RS226". Genome Taxonomy Database. สืบค้นเมื่อ 1 พฤษภาคม 2025.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  17. ↑ "bac120_r226.sp_label". Genome Taxonomy Database. สืบค้นเมื่อ 1 พฤษภาคม 2025.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)
  18. ↑ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. สืบค้นเมื่อ 1 พฤษภาคม 2025.{{cite web}}: CS1 maint: date auto-translated (ลิงก์)