CLASP1

CLASP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4K92
Ідентифікатори
Символи	CLASP1, MAST1, cytoplasmic linker associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 605852 MGI: 1923957 HomoloGene: 41024 GeneCards: CLASP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• kinetochore binding; • dystroglycan binding; • microtubule binding; • microtubule plus-end binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • центросома; • комплекс Ґольджі; • kinetochore microtubule; • мембрана; • cortical microtubule cytoskeleton; • focal adhesion; • веретено поділу; • centrosomal corona; • хромосома; • microtubule plus-end; • центр організації мікротрубочок; • cell cortex; • spindle microtubule; • cytoplasmic microtubule; • basal cortex; • екзосома; • центромера; • цитоскелет; • мікротрубочка; • кінетохор;
Біологічний процес	• establishment of epithelial cell polarity; • vesicle targeting; • Golgi organization; • GO:0043148 mitotic spindle organization; • regulation of epithelial to mesenchymal transition; • regulation of microtubule cytoskeleton organization; • positive regulation of epithelial cell migration; • exit from mitosis; • поділ клітини; • establishment or maintenance of cell polarity; • positive regulation of extracellular matrix disassembly; • positive regulation of basement membrane assembly involved in embryonic body morphogenesis; • negative regulation of microtubule depolymerization; • mitotic spindle assembly; • microtubule anchoring; • G2/M transition of mitotic cell cycle; • microtubule bundle formation; • negative regulation of microtubule polymerization or depolymerization; • positive regulation of microtubule polymerization; • regulation of focal adhesion assembly; • negative regulation of wound healing, spreading of epidermal cells; • клітинний цикл; • positive regulation of exocytosis; • negative regulation of stress fiber assembly; • establishment of spindle orientation; • astral microtubule organization; • microtubule organizing center organization; • establishment of mitotic spindle localization; • regulation of gastrulation; • microtubule cytoskeleton organization; • Нуклеація елементів цитоскелету; • sister chromatid cohesion; • ciliary basal body-plasma membrane docking; • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	23332
	76707
	ENSG00000074054
	ENSMUSG00000064302
	Q7Z460
	Q80TV8
NM_001142273; NM_001142274; NM_001207051; NM_015282; NM_001378003;
	NM_001378004; NM_001378005; NM_001395891
NM_001081276; NM_001293300; NM_001293301; NM_029709; NM_177548;
	NM_001359328; NM_001359329; NM_001359330; NM_001359331; NM_001359334; NM_001359335; NM_001359336; NM_001359337; NM_001359338; NM_001359339; NM_001359340; NM_001359341; NM_001359342; NM_001359343; NM_001359345; NM_001359346; NM_001359347
NP_001135745; NP_001135746; NP_001193980; NP_056097; NP_001364932;
	NP_001364933; NP_001364934
NP_001280229; NP_001280230; NP_083985; NP_001346257; NP_001346258;
	NP_001346259; NP_001346260; NP_001346263; NP_001346264; NP_001346265; NP_001346266; NP_001346267; NP_001346268; NP_001346269; NP_001346270; NP_001346271; NP_001346272; NP_001346274; NP_001346275; NP_001346276
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CLASP1 (англ. Cytoplasmic linker associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 538 амінокислот, а молекулярна маса — 169 451^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEPRMESCLA	QVLQKDVGKR	LQVGQELIDY	FSDKQKSADL	EHDQTMLDKL
VDGLATSWVN	SSNYKVVLLG	MDILSALVTR	LQDRFKAQIG	TVLPSLIDRL
GDAKDSVREQ	DQTLLLKIMD	QAANPQYVWD	RMLGGFKHKN	FRTREGICLC
LIATLNASGA	QTLTLSKIVP	HICNLLGDPN	SQVRDAAINS	LVEIYRHVGE
RVRADLSKKG	LPQSRLNVIF	TKFDEVQKSG	NMIQSANDKN	FDDEDSVDGN
RPSSASSTSS	KAPPSSRRNV	GMGTTRRLGS	STLGSKSSAA	KEGAGAVDEE
DFIKAFDDVP	VVQIYSSRDL	EESINKIREI	LSDDKHDWEQ	RVNALKKIRS
LLLAGAAEYD	NFFQHLRLLD	GAFKLSAKDL	RSQVVREACI	TLGHLSSVLG
NKFDHGAEAI	MPTIFNLIPN	SAKIMATSGV	VAVRLIIRHT	HIPRLIPVIT
SNCTSKSVAV	RRRCFEFLDL	LLQEWQTHSL	ERHISVLAET	IKKGIHDADS
EARIEARKCY	WGFHSHFSRE	AEHLYHTLES	SYQKALQSHL	KNSDSIVSLP
QSDRSSSSSQ	ESLNRPLSAK	RSPTGSTTSR	ASTVSTKSVS	TTGSLQRSRS
DIDVNAAASA	KSKVSSSSGT	TPFSSAAALP	PGSYASLGRI	RTRRQSSGSA
TNVASTPDNR	GRSRAKVVSQ	SQRSRSANPA	GAGSRSSSPG	KLLGSGYGGL
TGGSSRGPPV	TPSSEKRSKI	PRSQGCSRET	SPNRIGLARS	SRIPRPSMSQ
GCSRDTSRES	SRDTSPARGF	PPLDRFGLGQ	PGRIPGSVNA	MRVLSTSTDL
EAAVADALKK	PVRRRYEPYG	MYSDDDANSD	ASSVCSERSY	GSRNGGIPHY
LRQTEDVAEV	LNHCASSNWS	ERKEGLLGLQ	NLLKSQRTLS	RVELKRLCEI
FTRMFADPHS	KRVFSMFLET	LVDFIIIHKD	DLQDWLFVLL	TQLLKKMGAD
LLGSVQAKVQ	KALDVTRDSF	PFDQQFNILM	RFIVDQTQTP	NLKVKVAILK
YIESLARQMD	PTDFVNSSET	RLAVSRIITW	TTEPKSSDVR	KAAQIVLISL
FELNTPEFTM	LLGALPKTFQ	DGATKLLHNH	LKNSSNTSVG	SPSNTIGRTP
SRHTSSRTSP	LTSPTNCSHG	GLSPSRLWGW	SADGLAKHPP	PFSQPNSIPT
APSHKALRRS	YSPSMLDYDT	ENLNSEEIYS	SLRGVTEAIE	KFSFRSQEDL
NEPIKRDGKK	ECDIVSRDGG	AASPATEGRG	GSEVEGGRTA	LDNKTSLLNT
QPPRAFPGPR	ARDYNPYPYS	DAINTYDKTA	LKEAVFDDDM	EQLRDVPIDH
SDLVADLLKE	LSNHNERVEE	RKGALLELLK	ITREDSLGVW	EEHFKTILLL
LLETLGDKDH	SIRALALRVL	REILRNQPAR	FKNYAELTIM	KTLEAHKDSH
KEVVRAAEEA	ASTLASSIHP	EQCIKVLCPI	IQTADYPINL	AAIKMQTKVV
ERIAKESLLQ	LLVDIIPGLL	QGYDNTESSV	RKASVFCLVA	IYSVIGEDLK
PHLAQLTGSK	MKLLNLYIKR	AQTTNSNSSS	SSDVSTHS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, хромосомах, центромерах, апараті гольджі, кінетохорі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17088 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q7Z460 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17088 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q7Z460 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]