COPG1

COPG1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1R4X
Ідентифікатори
Символи	COPG1, COPG, coatomer protein complex subunit gamma 1, COPI coat complex subunit gamma 1
Зовнішні ІД	OMIM: 615525 MGI: 1858696 HomoloGene: 56745 GeneCards: COPG1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • structural molecule activity Клітинна компонента • цитоплазма • membrane coat • COPI-coated vesicle membrane • мембрана • transport vesicle • гіалоплазма • GO:0016023 цитоплазматичний міхур • комплекс Ґольджі • Golgi membrane • COPI vesicle coat • мембрана ендоплазматичного ретикулуму • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment Біологічний процес • retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum • транспорт білків • organelle transport along microtubule • intracellular protein transport • establishment of Golgi localization • везикулярний транспорт від ендоплазматичного ретикулуму до апарату Гольджі • vesicle-mediated transport • intra-Golgi vesicle-mediated transport • protein secretion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22820	54161
Ensembl	ENSG00000181789	ENSMUSG00000030058
UniProt	Q9Y678	Q9QZE5
RefSeq (мРНК)	NM_016128	NM_017477 NM_201244
RefSeq (білок)	NP_057212	NP_059505 NP_957696
Локус (UCSC)	Хр. 3: 129.25 – 129.28 Mb	Хр. 6: 87.86 – 87.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COPG1 (англ. Coatomer protein complex subunit gamma 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 874 амінокислот, а молекулярна маса — 97 718.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLKKFDKKDE		ESGGGSNPFQ		HLEKSAVLQE		ARVFNETPIN		PRKCAHILTK
ILYLINQGEH		LGTTEATEAF		FAMTKLFQSN		DPTLRRMCYL		TIKEMSCIAE
DVIIVTSSLT		KDMTGKEDNY		RGPAVRALCQ		ITDSTMLQAI		ERYMKQAIVD
KVPSVSSSAL		VSSLHLLKCS		FDVVKRWVNE		AQEAASSDNI		MVQYHALGLL
YHVRKNDRLA		VNKMISKVTR		HGLKSPFAYC		MMIRVASKQL		EEEDGSRDSP
LFDFIESCLR		NKHEMVVYEA		ASAIVNLPGC		SAKELAPAVS		VLQLFCSSPK
AALRYAAVRT		LNKVAMKHPS		AVTACNLDLE		NLVTDSNRSI		ATLAITTLLK
TGSESSIDRL		MKQISSFMSE		ISDEFKVVVV		QAISALCQKY		PRKHAVLMNF
LFTMLREEGG		FEYKRAIVDC		IISIIEENSE		SKETGLSHLC		EFIEDCEFTV
LATRILHLLG		QEGPKTTNPS		KYIRFIYNRV		VLEHEEVRAG		AVSALAKFGA
QNEEMLPSIL		VLLKRCVMDD		DNEVRDRATF		YLNVLEQKQK		ALNAGYILNG
LTVSIPGLER		ALQQYTLEPS		EKPFDLKSVP		LATAPMAEQR		TESTPITAVK
QPEKVAATRQ		EIFQEQLAAV		PEFRGLGPLF		KSSPEPVALT		ESETEYVIRC
TKHTFTNHMV		FQFDCTNTLN		DQTLENVTVQ		MEPTEAYEVL		CYVPARSLPY
NQPGTCYTLV		ALPKEDPTAV		ACTFSCMMKF		TVKDCDPTTG		ETDDEGYEDE
YVLEDLEVTV		ADHIQKVMKL		NFEAAWDEVG		DEFEKEETFT		LSTIKTLEEA
VGNIVKFLGM		HPCERSDKVP		DNKNTHTLLL		AGVFRGGHDI		LVRSRLLLLD
TVTMQVTARS		LEELPVDIIL		ASVG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт, транспорт білків, транспорт між ендоплазматичним ретикулумом і апаратом Гольджі. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, цитоплазматичних везикулах, апараті Гольджі.

Література

• Futatsumori M., Kasai K., Takatsu H., Shin H.-W., Nakayama K. (2000). Identification and characterization of novel isoforms of COP I subunits. J. Biochem. 128: 793—801. PMID 11056392 doi:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022817
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Watson P.J., Frigerio G., Collins B.M., Duden R., Owen D.J. (2004). Gamma-COP appendage domain -- structure and function. Traffic. 5: 79—88. PMID 14690497 doi:10.1111/j.1600-0854.2004.00158.x

Див. також

• Хромосома 3