RNF220

RNF220
Ідентифікатори
Символи	RNF220, C1orf164, ring finger protein 220, HLD23
Зовнішні ІД	OMIM: 616136 MGI: 1913993 HomoloGene: 10036 GeneCards: RNF220
шифр КФ	2.3.2.27
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • зв’язування з іоном металу • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • трансферазна активність Клітинна компонента • цитоплазма Біологічний процес • protein autoubiquitination • Убіквітин-залежний протеоліз • позитивна регуляція канонічного сигнального шляху Wnt Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55182	66743
Ensembl	ENSG00000187147	ENSMUSG00000028677
UniProt	Q5VTB9	Q6PDX6
RefSeq (мРНК)	NM_018150 NM_001319956 NM_001319957 NM_001376486 NM_001376487 NM_001376488 NM_001376489 NM_016501	NM_025739 NM_001310729 NM_001310730 NM_001310731
RefSeq (білок)	NP_001306885 NP_001306886 NP_060620 NP_001363415 NP_001363416 NP_001363417 NP_001363418	NP_001297658 NP_001297659 NP_001297660 NP_080015
Локус (UCSC)	Хр. 1: 44.41 – 44.65 Mb	Хр. 4: 117.13 – 117.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RNF220 (англ. Ring finger protein 220) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 566 амінокислот, а молекулярна маса — 62 765.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLHRAAFKM		ENSSYLPNPL		ASPALMVLAS		TAEASRDASI		PCQQPRPFGV
PVSVDKDVHI		PFTNGSYTFA		SMYHRQGGVP		GTFANRDFPP		SLLHLHPQFA
PPNLDCTPIS		MLNHSGVGAF		RPFASTEDRE		SYQSAFTPAK		RLKNCHDTES
PHLRFSDADG		KEYDFGTQLP		SSSPGSLKVD		DTGKKIFAVS		GLISDREASS
SPEDRNDRCK		KKAAALFDSQ		APICPICQVL		LRPSELQEHM		EQELEQLAQL
PSSKNSLLKD		AMAPGTPKSL		LLSASIKREG		ESPTASPHSS		ATDDLHHSDR
YQTFLRVRAN		RQTRLNARIG		KMKRRKQDEG		QREGSCMAED		DAVDIEHENN
NRFEEYEWCG		QKRIRATTLL		EGGFRGSGFI		MCSGKENPDS		DADLDVDGDD
TLEYGKPQYT		EADVIPCTGE		EPGEAKEREA		LRGAVLNGGP		PSTRITPEFS
KWASDEMPST		SNGESSKQEA		MQKTCKNSDI		EKITEDSAVT		TFEALKARVR
ELERQLSRGD		RYKCLICMDS		YSMPLTSIQC		WHVHCEECWL		RTLGAKKLCP
QCNTITAPGD		LRRIYL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1