TRIM22

TRIM22
Ідентифікатори
Символи	TRIM22, GPSTAF50, RNF94, STAF50, tripartite motif containing 22
Зовнішні ІД	OMIM: 606559 HomoloGene: 48399 GeneCards: TRIM22
шифр КФ	2.3.2.27
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein-macromolecule adaptor activity; • GO:0001106 transcription corepressor activity; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • зв'язування з іонами цинку; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • protein kinase binding; • трансферазна активність;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • Тільце Кахаля; • nuclear speck; • внутрішньоклітинний; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • ядерні тільця; • комплекс Ґольджі;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of autophagy; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • protein trimerization; • response to virus; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • ДНК-матрична транскрипція; • regulation of protein localization; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • defense response to virus; • Убіквітин-залежний протеоліз; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of nucleic acid-templated transcription;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10346
	н/д
	ENSG00000132274
	н/д
	Q8IYM9
	н/д
	NM_006074; NM_001199573
	н/д
	NP_001186502; NP_006065
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей

TRIM22 (англ. Tripartite motif containing 22) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[2] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 498 амінокислот, а молекулярна маса — 56 947^[3].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDFSVKVDIE	KEVTCPICLE	LLTEPLSLDC	GHSFCQACIT	AKIKESVIIS
RGESSCPVCQ	TRFQPGNLRP	NRHLANIVER	VKEVKMSPQE	GQKRDVCEHH
GKKLQIFCKE	DGKVICWVCE	LSQEHQGHQT	FRINEVVKEC	QEKLQVALQR
LIKEDQEAEK	LEDDIRQERT	AWKNYIQIER	QKILKGFNEM	RVILDNEEQR
ELQKLEEGEV	NVLDNLAAAT	DQLVQQRQDA	STLISDLQRR	LRGSSVEMLQ
DVIDVMKRSE	SWTLKKPKSV	SKKLKSVFRV	PDLSGMLQVL	KELTDVQYYW
VDVMLNPGSA	TSNVAISVDQ	RQVKTVRTCT	FKNSNPCDFS	AFGVFGCQYF
SSGKYYWEVD	VSGKIAWILG	VHSKISSLNK	RKSSGFAFDP	SVNYSKVYSR
YRPQYGYWVI	GLQNTCEYNA	FEDSSSSDPK	VLTLFMAVPP	CRIGVFLDYE
AGIVSFFNVT	NHGALIYKFS	GCRFSRPAYP	YFNPWNCLVP	MTVCPPSS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, репресорів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Tissot C., Mechti N. (1995). Molecular cloning of a new interferon-induced factor that represses human immunodeficiency virus type 1 long terminal repeat expression. J. Biol. Chem. 270: 14891—14898. PMID 7797467 doi:10.1074/jbc.270.25.14891
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Duan Z., Gao B., Xu W., Xiong S. (2008). Identification of TRIM22 as a RING finger E3 ubiquitin ligase. Biochem. Biophys. Res. Commun. 374: 502—506. PMID 18656448 doi:10.1016/j.bbrc.2008.07.070
Barr S.D., Smiley J.R., Bushman F.D. (2008). The interferon response inhibits HIV particle production by induction of TRIM22. PLoS Pathog. 4: E1000007—E1000007. PMID 18389079 doi:10.1371/journal.ppat.1000007
Sivaramakrishnan G., Sun Y., Tan S.K., Lin V.C. (2009). Dynamic localization of tripartite motif-containing 22 in nuclear and nucleolar bodies. Exp. Cell Res. 315: 1521—1532. PMID 19331816 doi:10.1016/j.yexcr.2009.01.028
Sivaramakrishnan G., Sun Y., Rajmohan R., Lin V.C. (2009). B30.2/SPRY domain in tripartite motif-containing 22 is essential for the formation of distinct nuclear bodies. FEBS Lett. 583: 2093—2099. PMID 19481078 doi:10.1016/j.febslet.2009.05.036

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16379 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-26 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q8IYM9 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[HGNC-2] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16379 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-26 у Wayback Machine.]

[UniProt-3] UniProt, Q8IYM9 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]