CDH1

CDH1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1O6S, 2O72, 2OMT, 2OMU, 2OMV, 2OMX, 2OMY, 2OMZ, 3FF7, 3FF8, 3L6X, 3L6Y, 4ZT1, 4ZTE
Ідентифікатори
Символи	CDH1, Arc-1, CD324, CDHE, ECAD, LCAM, UVO, cadherin 1, BCDS1, E-cadherin, uvomorulin
Зовнішні ІД	OMIM: 192090 MGI: 88354 HomoloGene: 20917 GeneCards: CDH1
Пов'язані генетичні захворювання
	колоректальний рак, Blepharo-cheilo-odontic syndrome, hereditary diffuse gastric cancer
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв'язування з іоном кальцію; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • ankyrin binding; • зв’язування з γ-катеніном; • зв'язування β-катеніну; • GTPase activating protein binding; • зв’язування з іоном металу; • зв'язування з молекулами клітинної адгезії; • зв'язування з кадгерином; • identical protein binding; • cytoskeletal protein binding; • гомодимеризація білків;
Клітинна компонента	• apical junction complex; • trans-Golgi network; • extracellular region; • перинуклеарна ділянка цитоплазми; • cortical actin cytoskeleton; • комплекс Ґольджі; • lamellipodium; • цитоплазматичний бік плазматичної мембрани; • ендосома; • lateral plasma membrane; • катеніновий комплекс; • actin cytoskeleton; • flotillin complex; • мембрана; • екзосома; • інтегральний компонент мембрани; • міжклітинні контакти; • цитоплазма; • клітинна мембрана; • поверхня клітини; • postsynapse; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• negative regulation of cell-cell adhesion; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • cellular response to lithium ion; • адгезія клітин; • extracellular matrix organization; • клітинна відповідь на індол-3-метанол; • деградація позаклітинного матриксу; • synapse assembly; • pituitary gland development; • response to toxic substance; • відгук на органічну речовину; • neuron projection development; • adherens junction organization; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • entry of bacterium into host cell; • protein localization to plasma membrane; • cell-cell adhesion; • GO:0000767 cell morphogenesis; • cell-cell junction assembly; • регуляція експресії генів; • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • negative regulation of cell migration; • позитивна регуляція імпорту білків у ядро; • cell-cell adhesion mediated by cadherin; • regulation of protein catabolic process at postsynapse, modulating synaptic transmission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	999
	12550
	ENSG00000039068
	ENSMUSG00000000303
	P12830
	P09803
	NM_004360; NM_001317184; NM_001317185; NM_001317186
	NM_009864
	NP_001304113; NP_001304114; NP_001304115; NP_004351
	NP_033994
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDH1 (англ. Cadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 882 амінокислот, а молекулярна маса — 97 456^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGPWSRSLSA	LLLLLQVSSW	LCQEPEPCHP	GFDAESYTFT	VPRRHLERGR
VLGRVNFEDC	TGRQRTAYFS	LDTRFKVGTD	GVITVKRPLR	FHNPQIHFLV
YAWDSTYRKF	STKVTLNTVG	HHHRPPPHQA	SVSGIQAELL	TFPNSSPGLR
RQKRDWVIPP	ISCPENEKGP	FPKNLVQIKS	NKDKEGKVFY	SITGQGADTP
PVGVFIIERE	TGWLKVTEPL	DRERIATYTL	FSHAVSSNGN	AVEDPMEILI
TVTDQNDNKP	EFTQEVFKGS	VMEGALPGTS	VMEVTATDAD	DDVNTYNAAI
AYTILSQDPE	LPDKNMFTIN	RNTGVISVVT	TGLDRESFPT	YTLVVQAADL
QGEGLSTTAT	AVITVTDTND	NPPIFNPTTY	KGQVPENEAN	VVITTLKVTD
ADAPNTPAWE	AVYTILNDDG	GQFVVTTNPV	NNDGILKTAK	GLDFEAKQQY
ILHVAVTNVV	PFEVSLTTST	ATVTVDVLDV	NEAPIFVPPE	KRVEVSEDFG
VGQEITSYTA	QEPDTFMEQK	ITYRIWRDTA	NWLEINPDTG	AISTRAELDR
EDFEHVKNST	YTALIIATDN	GSPVATGTGT	LLLILSDVND	NAPIPEPRTI
FFCERNPKPQ	VINIIDADLP	PNTSPFTAEL	THGASANWTI	QYNDPTQESI
ILKPKMALEV	GDYKINLKLM	DNQNKDQVTT	LEVSVCDCEG	AAGVCRKAQP
VEAGLQIPAI	LGILGGILAL	LILILLLLLF	LRRRAVVKEP	LLPPEDDTRD
NVYYYDEEGG	GEEDQDFDLS	QLHRGLDARP	EVTRNDVAPT	LMSVPRYLPR
PANPDEIGNF	IDENLKAADT	DPTAPPYDSL	LVFDYEGSGS	EAASLSSLNS
SESDKDQDYD	YLNEWGNRFK	KLADMYGGGE	DD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, апараті гольджі, ендосомах.

Література

Bussemakers M.J.G., Mees S.G.M., van Bokhoven A., Debruyne F.M.J., Schalken J.A. (1993). Molecular cloning and characterization of the human E-cadherin cDNA. Mol. Biol. Rep. 17: 123—128. PMID 8459805 doi:10.1007/BF00996219
Rimm D.L., Morrow J.S. (1994). Molecular cloning of human E-cadherin suggests a novel subdivision of the cadherin superfamily. Biochem. Biophys. Res. Commun. 200: 1754—1761. PMID 8185635 doi:10.1006/bbrc.1994.1656
Bussemakers M.J.G., Giroldi L.A., van Bokhoven A., Schalken J.A. (1994). Transcriptional regulation of the human E-cadherin gene in human prostate cancer cell lines: characterization of the human E-cadherin gene promoter. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203: 1284—1290. PMID 8093045 doi:10.1006/bbrc.1994.2321
Mansouri A., Spurr N., Goodfellow P.N., Kemler R. (1988). Characterization and chromosomal localization of the gene encoding the human cell adhesion molecule uvomorulin. Differentiation. 38: 67—71. PMID 3263290 doi:10.1111/j.1432-0436.1988.tb00593.x
Ozawa M., Ringwald M., Kemler R. (1990). Uvomorulin-catenin complex formation is regulated by a specific domain in the cytoplasmic region of the cell adhesion molecule. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 4246—4250. PMID 2349235 doi:10.1073/pnas.87.11.4246
Butz S., Kemler R. (1994). Distinct cadherin-catenin complexes in Ca(2+)-dependent cell-cell adhesion. FEBS Lett. 355: 195—200. PMID 7982500 doi:10.1016/0014-5793(94)01205-9

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1748 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P12830 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CDH1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1748 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P12830 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350