PDGFRB

PDGFRB
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1GQ5, 1H9O, 1SHA, 2L6W, 2PLD, 2PLE, 3MJG
Ідентифікатори
Символи	PDGFRB, CD140B, IBGC4, IMF1, JTK12, PDGFR, PDGFR-1, PDGFR1, KOGS, PENTT, platelet derived growth factor receptor beta
Зовнішні ІД	OMIM: 173410 MGI: 97531 HomoloGene: 1960 GeneCards: PDGFRB
шифр КФ	2.7.10.1
Пов'язані генетичні захворювання
	гострий мієлоїдний лейкоз, juvenile myelomonocytic leukemia, infantile myofibromatosis, Kosaki overgrowth syndrome, acroosteolysis-keloid-like lesions-premature aging syndrome
Реагує на сполуку
	cediranib, crenolanib, linifanib, Масітиніб, Нінтеданіб, Пазопаніб, semaxanib, сунітиніб, vatalanib, Нінтеданіб, іматиніб, Масітиніб, Бекаплермін, famitinib, orantinib, PD166285, MLN-518, imatinib mesylate
Онтологія гена
Молекулярна функція	• vascular endothelial growth factor binding; • кіназна активність; • platelet-derived growth factor-activated receptor activity; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • signaling receptor binding; • зв'язування з АТФ; • протеїнкіназна активність; • platelet-derived growth factor binding; • platelet activating factor receptor activity; • трансферазна активність; • platelet-derived growth factor receptor binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • protein tyrosine kinase activity; • protein kinase binding; • platelet-derived growth factor beta-receptor activity; • зв'язування з нуклеотидами; • phosphatidylinositol 3-kinase binding; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity; • enzyme binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • focal adhesion; • клітинне ядро; • apical plasma membrane; • лізосома; • екзосома; • інтегральний компонент мембрани; • клітинна мембрана; • lysosomal lumen; • intrinsic component of plasma membrane; • GO:0016023 цитоплазматичний міхур; • поверхня клітини; • комплекс Ґольджі; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • рецепторний комплекс;
Біологічний процес	• positive regulation of MAP kinase activity; • positive regulation of phospholipase C activity; • cell migration involved in vasculogenesis; • cardiac myofibril assembly; • positive regulation of smooth muscle cell migration; • protein phosphorylation; • response to lipid; • positive regulation of phosphoprotein phosphatase activity; • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process; • metanephric glomerular mesangial cell proliferation involved in metanephros development; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • cell chemotaxis; • розвиток внутрішнього вуха; • metanephric S-shaped body morphogenesis; • positive regulation of mitotic nuclear division; • platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway; • positive regulation of collagen biosynthetic process; • phosphatidylinositol metabolic process; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • cell migration involved in coronary angiogenesis; • metanephric comma-shaped body morphogenesis; • positive regulation of chemotaxis; • positive regulation of DNA biosynthetic process; • protein autophosphorylation; • platelet-derived growth factor receptor signaling pathway; • response to toxic substance; • positive regulation of metanephric mesenchymal cell migration by platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway; • regulation of actin cytoskeleton organization; • response to retinoic acid; • фосфорилювання; • response to hyperoxia; • retina vasculature development in camera-type eye; • metanephric glomerulus morphogenesis; • metanephric mesenchymal cell migration; • Загоєння ран; • cellular response to platelet-derived growth factor stimulus; • negative regulation of apoptotic process; • response to fluid shear stress; • response to estrogen; • хемотаксис; • metanephric mesenchyme development; • response to hydrogen peroxide; • positive regulation of smooth muscle cell proliferation; • response to estradiol; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • GO:1904578 response to organic cyclic compound; • smooth muscle cell chemotaxis; • positive regulation of cell migration; • aorta morphogenesis; • MAPK cascade; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity; • metanephric glomerular capillary formation; • розвиток багатоклітинного організму; • positive regulation of calcium ion import; • glycosaminoglycan biosynthetic process; • positive regulation of cell population proliferation; • positive regulation of cell proliferation by VEGF-activated platelet derived growth factor receptor signaling pathway; • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • cell migration; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • positive regulation of Rho protein signal transduction; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process; • positive regulation of hepatic stellate cell activation; • positive regulation of fibroblast proliferation; • позитивна регуляція апоптозу; • GO:0010260 старіння людини; • male gonad development; • lung growth; • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway; • phosphatidylinositol-mediated signaling; • positive regulation of protein kinase B signaling; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • positive regulation of MAPK cascade;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5159
	18596
	ENSG00000113721
	ENSMUSG00000024620
	P09619
	P05622
	NM_002609; NM_001355016; NM_001355017
	NM_001146268; NM_008809
	NP_002600; NP_001341945; NP_001341946
	NP_001139740; NP_032835
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDGFRB (англ. Platelet derived growth factor receptor beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 106 амінокислот, а молекулярна маса — 123 968^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLPGAMPAL	ALKGELLLLS	LLLLLEPQIS	QGLVVTPPGP	ELVLNVSSTF
VLTCSGSAPV	VWERMSQEPP	QEMAKAQDGT	FSSVLTLTNL	TGLDTGEYFC
THNDSRGLET	DERKRLYIFV	PDPTVGFLPN	DAEELFIFLT	EITEITIPCR
VTDPQLVVTL	HEKKGDVALP	VPYDHQRGFS	GIFEDRSYIC	KTTIGDREVD
SDAYYVYRLQ	VSSINVSVNA	VQTVVRQGEN	ITLMCIVIGN	EVVNFEWTYP
RKESGRLVEP	VTDFLLDMPY	HIRSILHIPS	AELEDSGTYT	CNVTESVNDH
QDEKAINITV	VESGYVRLLG	EVGTLQFAEL	HRSRTLQVVF	EAYPPPTVLW
FKDNRTLGDS	SAGEIALSTR	NVSETRYVSE	LTLVRVKVAE	AGHYTMRAFH
EDAEVQLSFQ	LQINVPVRVL	ELSESHPDSG	EQTVRCRGRG	MPQPNIIWSA
CRDLKRCPRE	LPPTLLGNSS	EEESQLETNV	TYWEEEQEFE	VVSTLRLQHV
DRPLSVRCTL	RNAVGQDTQE	VIVVPHSLPF	KVVVISAILA	LVVLTIISLI
ILIMLWQKKP	RYEIRWKVIE	SVSSDGHEYI	YVDPMQLPYD	STWELPRDQL
VLGRTLGSGA	FGQVVEATAH	GLSHSQATMK	VAVKMLKSTA	RSSEKQALMS
ELKIMSHLGP	HLNVVNLLGA	CTKGGPIYII	TEYCRYGDLV	DYLHRNKHTF
LQHHSDKRRP	PSAELYSNAL	PVGLPLPSHV	SLTGESDGGY	MDMSKDESVD
YVPMLDMKGD	VKYADIESSN	YMAPYDNYVP	SAPERTCRAT	LINESPVLSY
MDLVGFSYQV	ANGMEFLASK	NCVHRDLAAR	NVLICEGKLV	KICDFGLARD
IMRDSNYISK	GSTFLPLKWM	APESIFNSLY	TTLSDVWSFG	ILLWEIFTLG
GTPYPELPMN	EQFYNAIKRG	YRMAQPAHAS	DEIYEIMQKC	WEEKFEIRPP
FSQLVLLLER	LLGEGYKKKY	QQVDEEFLRS	DHPAILRSQA	RLPGFHGLRS
PLDTSSVLYT	AVQPNEGDND	YIIPLPDPKP	EVADEGPLEG	SPSLASSTLN
EVNTSSTISC	DSPLEPQDEP	EPEPQLELQV	EPEPELEQLP	DSGCPAPRAE
AEDSFL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, білків розвитку, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як хемотаксис, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Roberts W.M., Look A.T., Roussel M.F., Sherr C.J. (1988). Tandem linkage of human CSF-1 receptor (c-fms) and PDGF receptor genes. Cell. 55: 655—661. PMID 2846185 doi:10.1016/0092-8674(88)90224-3
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504
Kazlauskas A., Cooper J.A. (1989). Autophosphorylation of the PDGF receptor in the kinase insert region regulates interactions with cell proteins. Cell. 58: 1121—1133. PMID 2550144 doi:10.1016/0092-8674(89)90510-2
Sorkin A., Westermark B., Heldin C.H., Claesson-Welsh L. (1991). Effect of receptor kinase inactivation on the rate of internalization and degradation of PDGF and the PDGF beta-receptor. J. Cell Biol. 112: 469—478. PMID 1846866 doi:10.1083/jcb.112.3.469
Kazlauskas A., Kashishian A., Cooper J.A., Valius M. (1992). GTPase-activating protein and phosphatidylinositol 3-kinase bind to distinct regions of the platelet-derived growth factor receptor beta subunit. Mol. Cell. Biol. 12: 2534—2544. PMID 1375321 doi:10.1128/MCB.12.6.2534

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PDGFRB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Platelet derived growth factor receptor beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8804 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2015. Процитовано 5 вересня 2017. [Архівовано 2015-03-27 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P09619 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PDGFRB переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Platelet derived growth factor receptor beta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8804 (англ.) . Архів оригіналу за 27 березня 2015. Процитовано 5 вересня 2017. [Архівовано 2015-03-27 у Wayback Machine.]

[UniProt-6] UniProt, P09619 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350