PTPRC

PTPRC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1YGU, 1YGR, 5FMV, 5FN6, 5FN7
Ідентифікатори
Символи	PTPRC, B220, CD45, CD45R, GP180, L-CA, LCA, LY5, T200, protein tyrosine phosphatase, receptor type C, protein tyrosine phosphatase receptor type C
Зовнішні ІД	OMIM: 151460 MGI: 97810 HomoloGene: 2126 GeneCards: PTPRC
шифр КФ	3.1.3.48
Пов'язані генетичні захворювання
	неспецифічний виразковий коліт
Онтологія гена
Молекулярна функція	• phosphoprotein phosphatase activity; • GO:0098519, GO:0098518 phosphatase activity; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase activity; • protein kinase binding; • гідролазна активність; • protein tyrosine phosphatase activity;
Клітинна компонента	• інтегральний компонент мембрани; • мембрана; • focal adhesion; • клітинна мембрана; • інтегральний компонент плазматичної мембрани; • поверхня клітини; • membrane raft; • екзосома; • зовнішня поверхня плазматичної мембрани; • secretory granule membrane;
Біологічний процес	• B cell receptor signaling pathway; • cell cycle phase transition; • release of sequestered calcium ion into cytosol; • negative regulation of protein kinase activity; • bone marrow development; • stem cell development; • GO:0016576 protein dephosphorylation; • negative regulation of cytokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of hematopoietic stem cell migration; • regulation of cell cycle; • negative regulation of cell adhesion involved in substrate-bound cell migration; • negative regulation of T cell mediated cytotoxicity; • cell surface receptor signaling pathway; • B cell proliferation; • T cell differentiation; • positive regulation of B cell proliferation; • defense response to virus; • positive regulation of T cell proliferation; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • positive regulation of antigen receptor-mediated signaling pathway; • T cell receptor signaling pathway; • positive regulation of stem cell proliferation; • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання; • positive regulation of protein kinase activity; • peptidyl-tyrosine dephosphorylation; • дегрануляція нейтрофілів;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5788
	19264
	ENSG00000081237; ENSG00000262418
	ENSMUSG00000026395
	P08575
	P06800
	NM_001267798; NM_002838; NM_080921; NM_080922
	NM_001111316; NM_001268286; NM_011210
	NP_001254727; NP_002829; NP_563578; NP_563578.2; NP_002829.3
	NP_001104786; NP_001255215; NP_035340
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PTPRC (англ. Protein tyrosine phosphatase, receptor type C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 304 амінокислот, а молекулярна маса — 147 254^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYLWLKLLAF	GFAFLDTEVF	VTGQSPTPSP	TGLTTAKMPS	VPLSSDPLPT
HTTAFSPAST	FERENDFSET	TTSLSPDNTS	TQVSPDSLDN	ASAFNTTGVS
SVQTPHLPTH	ADSQTPSAGT	DTQTFSGSAA	NAKLNPTPGS	NAISDVPGER
STASTFPTDP	VSPLTTTLSL	AHHSSAALPA	RTSNTTITAN	TSDAYLNASE
TTTLSPSGSA	VISTTTIATT	PSKPTCDEKY	ANITVDYLYN	KETKLFTAKL
NVNENVECGN	NTCTNNEVHN	LTECKNASVS	ISHNSCTAPD	KTLILDVPPG
VEKFQLHDCT	QVEKADTTIC	LKWKNIETFT	CDTQNITYRF	QCGNMIFDNK
EIKLENLEPE	HEYKCDSEIL	YNNHKFTNAS	KIIKTDFGSP	GEPQIIFCRS
EAAHQGVITW	NPPQRSFHNF	TLCYIKETEK	DCLNLDKNLI	KYDLQNLKPY
TKYVLSLHAY	IIAKVQRNGS	AAMCHFTTKS	APPSQVWNMT	VSMTSDNSMH
VKCRPPRDRN	GPHERYHLEV	EAGNTLVRNE	SHKNCDFRVK	DLQYSTDYTF
KAYFHNGDYP	GEPFILHHST	SYNSKALIAF	LAFLIIVTSI	ALLVVLYKIY
DLHKKRSCNL	DEQQELVERD	DEKQLMNVEP	IHADILLETY	KRKIADEGRL
FLAEFQSIPR	VFSKFPIKEA	RKPFNQNKNR	YVDILPYDYN	RVELSEINGD
AGSNYINASY	IDGFKEPRKY	IAAQGPRDET	VDDFWRMIWE	QKATVIVMVT
RCEEGNRNKC	AEYWPSMEEG	TRAFGDVVVK	INQHKRCPDY	IIQKLNIVNK
KEKATGREVT	HIQFTSWPDH	GVPEDPHLLL	KLRRRVNAFS	NFFSGPIVVH
CSAGVGRTGT	YIGIDAMLEG	LEAENKVDVY	GYVVKLRRQR	CLMVQVEAQY
ILIHQALVEY	NQFGETEVNL	SELHPYLHNM	KKRDPPSEPS	PLEAEFQRLP
SYRSWRTQHI	GNQEENKSKN	RNSNVIPYDY	NRVPLKHELE	MSKESEHDSD
ESSDDDSDSE	EPSKYINASF	IMSYWKPEVM	IAAQGPLKET	IGDFWQMIFQ
RKVKVIVMLT	ELKHGDQEIC	AQYWGEGKQT	YGDIEVDLKD	TDKSSTYTLR
VFELRHSKRK	DSRTVYQYQY	TNWSVEQLPA	EPKELISMIQ	VVKQKLPQKN
SSEGNKHHKS	TPLLIHCRDG	SQQTGIFCAL	LNLLESAETE	EVVDIFQVVK
ALRKARPGMV	STFEQYQFLY	DVIASTYPAQ	NGQVKKNNHQ	EDKIEFDNEV
DKVKQDANCV	NPLGAPEKLP	EAKEQAEGSE	PTSGTEGPEH	SVNGPASPAL
NQGS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеїн-фосфатаз. Локалізований у мембрані.

Література

Streuli M., Hall L.R., Saga Y., Schlossman S.F., Saito H. (1987). Differential usage of three exons generates at least five different mRNAs encoding human leukocyte common antigens. J. Exp. Med. 166: 1548—1566. PMID 2824653 doi:10.1084/jem.166.5.1548
Tsai A.Y.M., Streuli M., Saito H. (1989). Integrity of the exon 6 sequence is essential for tissue-specific alternative splicing of human leukocyte common antigen pre-mRNA. Mol. Cell. Biol. 9: 4550—4555. PMID 2531281 doi:10.1128/MCB.9.10.4550
Charbonneau H., Tonks N.K., Walsh K.A., Fischer E.H. (1988). The leukocyte common antigen (CD45): a putative receptor-linked protein tyrosine phosphatase. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 7182—7186. PMID 2845400 doi:10.1073/pnas.85.19.7182
Wu L., Fu J., Shen S.-H. (2002). SKAP55 coupled with CD45 positively regulates T-cell receptor-mediated gene transcription. Mol. Cell. Biol. 22: 2673—2686. PMID 11909961 doi:10.1128/MCB.22.8.2673-2686.2002
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 doi:10.1021/pr800500r
Nam H.J., Poy F., Saito H., Frederick C.A. (2005). Structural basis for the function and regulation of the receptor protein tyrosine phosphatase CD45. J. Exp. Med. 201: 441—452. PMID 15684325 doi:10.1084/jem.20041890

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PTPRC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9666 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P08575 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PTPRC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9666 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P08575 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350