EOMES

EOMES
Ідентифікатори
Символи	EOMES, TBR2, Eomesodermin
Зовнішні ІД	OMIM: 604615 MGI: 1201683 HomoloGene: 3971 GeneCards: EOMES
Пов'язані генетичні захворювання
ревматоїдний артрит, лімфогранульоматоз
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • chromatin binding • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • зв'язування з ДНК • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • внутрішньоклітинний Біологічний процес • stem cell population maintenance • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна • regulation of neurogenesis • гаструляція • trophectodermal cell differentiation • skeletal muscle cell differentiation • адаптивна імунна відповідь • розвиток багатоклітинного організму • диференціація клітин • blastocyst development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cerebral cortex neuron differentiation • regulation of neuron differentiation • CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation involved in immune response • ДНК-матрична транскрипція • olfactory bulb development • endodermal cell fate specification • cerebral cortex regionalization • cardioblast differentiation • процес імунної системи • positive regulation of cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • brain development • регуляція експресії генів • mesoderm formation • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • mesodermal to mesenchymal transition involved in gastrulation • endoderm formation • cell differentiation involved in embryonic placenta development • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • Нейрогенез • neuron differentiation • endoderm development • anatomical structure morphogenesis • mesendoderm development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8320	13813
Ensembl	ENSG00000163508	ENSMUSG00000032446
UniProt	O95936	O54839
RefSeq (мРНК)	NM_001278182 NM_001278183 NM_005442	NM_001164789 NM_010136
RefSeq (білок)	NP_001265111 NP_001265112 NP_005433	NP_001158261 NP_034266
Локус (UCSC)	Хр. 3: 27.72 – 27.72 Mb	Хр. 9: 118.31 – 118.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EOMES (англ. Eomesodermin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 686 амінокислот, а молекулярна маса — 72 732.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQLGEQLLVS		SVNLPGAHFY		PLESARGGSG		GSAGHLPSAA		PSPQKLDLDK
ASKKFSGSLS		CEAVSGEPAA		ASAGAPAAML		SDTDAGDAFA		SAAAVAKPGP
PDGRKGSPCG		EEELPSAAAA		AAAAAAAAAA		TARYSMDSLS		SERYYLQSPG
PQGSELAAPC		SLFPYQAAAG		APHGPVYPAP		NGARYPYGSM		LPPGGFPAAV
CPPGRAQFGP		GAGAGSGAGG		SSGGGGGPGT		YQYSQGAPLY		GPYPGAAAAG
SCGGLGGLGV		PGSGFRAHVY		LCNRPLWLKF		HRHQTEMIIT		KQGRRMFPFL
SFNINGLNPT		AHYNVFVEVV		LADPNHWRFQ		GGKWVTCGKA		DNNMQGNKMY
VHPESPNTGS		HWMRQEISFG		KLKLTNNKGA		NNNNTQMIVL		QSLHKYQPRL
HIVEVTEDGV		EDLNEPSKTQ		TFTFSETQFI		AVTAYQNTDI		TQLKIDHNPF
AKGFRDNYDS		SHQIVPGGRY		GVQSFFPEPF		VNTLPQARYY		NGERTVPQTN
GLLSPQQSEE		VANPPQRWLV		TPVQQPGTNK		LDISSYESEY		TSSTLLPYGI
KSLPLQTSHA		LGYYPDPTFP		AMAGWGGRGS		YQRKMAAGLP		WTSRTSPTVF
SEDQLSKEKV		KEEIGSSWIE		TPPSIKSLDS		NDSGVYTSAC		KRRRLSPSNS
SNENSPSIKC		EDINAEEYSK		DTSKGMGGYY		AFYTTP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, імунітет, транскрипція, регуляція транскрипції, гаструляція, диференціація, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Kimura N., Nakashima K., Ueno M., Taga T. (1999). A novel mammalian T-box-containing gene, Tbr2, expressed in mouse developing brain. Brain Res. Dev. Brain Res. 115: 183—193. PMID 10407135 doi:10.1016/S0165-3806(99)00064-4
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3