ZNF644

ZNF644
Ідентифікатори
Символи	ZNF644, BM-005, MYP21, NatF, ZEP-2, zinc finger protein 644
Зовнішні ІД	OMIM: 614159 MGI: 1277212 HomoloGene: 12971 GeneCards: ZNF644
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з ДНК • зв’язування з іоном металу • зв'язування з нуклеїновими кислотами • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ДНК-матрична транскрипція • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84146	52397
Ensembl	ENSG00000122482	ENSMUSG00000049606
UniProt	Q9H582	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_016620 NM_032186 NM_201269	NM_026856 NM_001363318 NM_001363319 NM_001363320 NM_001363321 NM_001363322 NM_001363323
RefSeq (білок)	NP_057704 NP_115562 NP_958357	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 90.92 – 91.02 Mb	Хр. 5: 106.62 – 106.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZNF644 (англ. Zinc finger protein 644) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 327 амінокислот, а молекулярна маса — 149 565.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRSFLQQDVN		KTKSRLNVLN		GLANNMDDLK		INTDITGAKE		ELLDDNNFIS
DKESGVHKPK		DCQTSFQKNN		TLTLPEELSK		DKSENALSGG		QSSLFIHAGA
PTVSSENFIL		PKGAAVNGPV		SHSSLTKTSN		MNKGSVSLTT		GQPVDQPTTE
SCSTLKVAAD		LQLSTPQKAS		QHQVLFLLSD		VAHAKNPTHS		NKKLPTSASV
GCDIQNSVGS		NIKSDGTLIN		QVEVGEDGED		LLVKDDCVNT		VTGISSGTDG
FRSENDTNWD		PQKEFIQFLM		TNEETVDKAP		PHSKIGLEKK		RKRKMDVSKI
TRYTEDCFSD		SNCVPNKSKM		QEVDFLEQNE		ELQAVDSQKY		ALSKVKPEST
DEDLESVDAF		QHLIYNPDKC		GEESSPVHTS		TFLSNTLKKK		CEESDSESPA
TFSTEEPSFY		PCTKCNVNFR		EKKHLHRHMM		YHLDGNSHFR		HLNVPRPYAC
RECGRTFRDR		NSLLKHMIIH		QERRQKLMEE		IRELKELQDE		GRSARLQCPQ
CVFGTNCPKT		FVQHAKTHEK		DKRYYCCEEC		NFMAVTENEL		ECHRGIAHGA
VVKCPMVTSD		IAQRKTQKKT		FMKDSVVGSS		KKSATYICKM		CPFTTSAKSV
LKKHTEYLHS		SSCVDSFGSP		LGLDKRKNDI		LEEPVDSDST		KTLTKQQSTT
FPKNSALKQD		VKRTFGSTSQ		SSSFSKIHKR		PHRIQKARKS		IAQSGVNMCN
QNSSPHKNVT		IKSSVDQKPK		YFHQAAKEKS		NAKANSHYLY		RHKYENYRMI
KKSGESYPVH		FKKEEASSLN		SLHLFSSSSN		SHNNFISDPH		KPDAKRPESF
KDHRRVAVKR		VIKESKKESS		VGGEDLDSYP		DFLHKMTVVV		LQKLNSAEKK
DSYETEDESS		WDNVELGDYT		TQAIEDETYS		DINQEHVNLF		PLFKSKVEGQ
EPGENATLSY		DQNDGFYFEY		YEDTGSNNFL		HEIHDPQHLE		TADASLSKHS
SVFHWTDLSL		EKKSCPYCPA		TFETGVGLSN		HVRGHLHRAG		LSYEARHVVS
PEQIATSDKM		QHFKRTGTGT		PVKRVRKAIE		KSETTSEHTC		QLCGGWFDTK
IGLSNHVRGH		LKRLGKTKWD		AHKSPICVLN		EMMQNEEKYE		KILKALNSRR
IIPRPFVAQK		LASSDDFISQ		NVIPLEAYRN		GLKTEALSVS		ASEEEGLNFL
NEYDETKPEL		PSGKKNQSLT		LIELLKNKRM		GEERNSAISP		QKIHNQTARK
RFVQKCVLPL		NEDSPLMYQP		QKMDLTMHSA		LDCKQKKSRS		RSGSKKKMLT
LPHGADEVYI		LRCRFCGLVF		RGPLSVQEDW		IKHLQRHIVN		ANLPRTGAGM
VEVTSLLKKP		ASITETSFSL		LMAEAAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 1