HOXC8

HOXC8
Ідентифікатори
Символи	HOXC8, HOX3, HOX3A, homeobox C8
Зовнішні ІД	OMIM: 142970 MGI: 96198 HomoloGene: 130642 GeneCards: HOXC8
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК • зв'язування з ДНК • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • microtubule cytoskeleton • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • розвиток багатоклітинного організму • skeletal system morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • ДНК-матрична транскрипція • anterior/posterior pattern specification • neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3224	15426
Ensembl	ENSG00000037965	н/д
UniProt	P31273	P09025
RefSeq (мРНК)	NM_022658	NM_010466
RefSeq (білок)	NP_073149	NP_034596
Локус (UCSC)	Хр. 12: 54.01 – 54.01 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXC8 (англ. Homeobox C8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 242 амінокислот, а молекулярна маса — 27 755.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSYFVNPLF		SKYKAGESLE		PAYYDCRFPQ		SVGRSHALVY		GPGGSAPGFQ
HASHHVQDFF		HHGTSGISNS		GYQQNPCSLS		CHGDASKFYG		YEALPRQSLY
GAQQEASVVQ		YPDCKSSANT		NSSEGQGHLN		QNSSPSLMFP		WMRPHAPGRR
SGRQTYSRYQ		TLELEKEFLF		NPYLTRKRRI		EVSHALGLTE		RQVKIWFQNR
RMKWKKENNK		DKLPGARDEE		KVEEEGNEEE		EKEEEEKEEN		KD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Flagiello D., Gibaud A., Dutrillaux B., Poupon M.-F., Malfoy B. (1997). Distinct patterns of all-trans retinoic acid dependent expression of HOXB and HOXC homeogenes in human embryonal and small-cell lung carcinoma cell lines. FEBS Lett. 415: 263—267. PMID 9357979 doi:10.1016/S0014-5793(97)01118-6

Див. також

• Хромосома 12