TAF2

TAF2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5FUR
Ідентифікатори
Символи	TAF2, CIF150, MRT40, TAF2B, TAFII150, TATA-box binding protein associated factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 604912 MGI: 2443028 HomoloGene: 31137 GeneCards: TAF2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• специфічне до послідовності зв'язування з ДНК; • chromatin binding; • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми; • TFIID-class transcription factor complex binding; • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity;
Клітинна компонента	• transcription factor TFTC complex; • transcription factor TFIID complex; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1904578 response to organic cyclic compound; • transcription by RNA polymerase II; • ДНК-матрична транскрипція; • G2/M transition of mitotic cell cycle; • transcription initiation from RNA polymerase II promoter; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • RNA polymerase II preinitiation complex assembly; • regulation of signal transduction by p53 class mediator;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6873
	319944
	ENSG00000064313
	ENSMUSG00000037343
	Q6P1X5
	Q8C176
	NM_003184
	NM_001081288; NM_177040
	NP_003175
	NP_001074757
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TAF2 (англ. TATA-box binding protein associated factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 199 амінокислот, а молекулярна маса — 136 971^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPLTGVEPAR	MNRKKGDKGF	ESPRPYKLTH	QVVCINNINF	QRKSVVGFVE
LTIFPTVANL	NRIKLNSKQC	RIYRVRINDL	EAAFIYNDPT	LEVCHSESKQ
RNLNYFSNAY	AAAVSAVDPD	AGNGELCIKV	PSELWKHVDE	LKVLKIHINF
SLDQPKGGLH	FVVPSVEGSM	AERGAHVFSC	GYQNSTRFWF	PCVDSYSELC
TWKLEFTVDA	AMVAVSNGDL	VETVYTHDMR	KKTFHYMLTI	PTAASNISLA
IGPFEILVDP	YMHEVTHFCL	PQLLPLLKHT	TSYLHEVFEF	YEEILTCRYP
YSCFKTVFID	EAYVEVAAYA	SMSIFSTNLL	HSAMIIDETP	LTRRCLAQSL
AQQFFGCFIS	RMSWSDEWVL	KGISGYIYGL	WMKKTFGVNE	YRHWIKEELD
KIVAYELKTG	GVLLHPIFGG	GKEKDNPASH	LHFSIKHPHT	LSWEYYSMFQ
CKAHLVMRLI	ENRISMEFML	QVFNKLLSLA	STASSQKFQS	HMWSQMLVST
SGFLKSISNV	SGKDIQPLIK	QWVDQSGVVK	FYGSFAFNRK	RNVLELEIKQ
DYTSPGTQKY	VGPLKVTVQE	LDGSFNHTLQ	IEENSLKHDI	PCHSKSRRNK
KKKIPLMNGE	EVDMDLSAMD	ADSPLLWIRI	DPDMSVLRKV	EFEQADFMWQ
YQLRYERDVV	AQQESILALE	KFPTPASRLA	LTDILEQEQC	FYRVRMSACF
CLAKIANSMV	STWTGPPAMK	SLFTRMFCCK	SCPNIVKTNN	FMSFQSYFLQ
KTMPVAMALL	RDVHNLCPKE	VLTFILDLIK	YNDNRKNKFS	DNYYRAEMID
ALANSVTPAV	SVNNEVRTLD	NLNPDVRLIL	EEITRFLNME	KLLPSYRHTI
TVSCLRAIRV	LQKNGHVPSD	PALFKSYAEY	GHFVDIRIAA	LEAVVDYTKV
DRSYEELQWL	LNMIQNDPVP	YVRHKILNML	TKNPPFTKNM	ESPLCNEALV
DQLWKLMNSG	TSHDWRLRCG	AVDLYFTLFG	LSRPSCLPLP	ELGLVLNLKE
KKAVLNPTII	PESVAGNQEA	ANNPSSHPQL	VGFQNPFSSS	QDEEEIDMDT
VHDSQAFISH	HLNMLERPST	PGLSKYRPAS	SRSALIPQHS	AGCDSTPTTK
PQWSLELARK	GTGKEQAPLE	MSMHPAASAP	LSVFTKESTA	SKHSDHHHHH
HHEHKKKKKK	HKHKHKHKHK	HDSKEKDKEP	FTFSSPASGR	SIRSPSLSD

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

Kaufmann J., Ahrens K., Koop R., Smale S.T., Muller R. (1998). CIF150, a human cofactor for transcription factor IID-dependent initiator function. Mol. Cell. Biol. 18: 233—239. PMID 9418870 doi:10.1128/MCB.18.1.233
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Cavusoglu N., Brand M., Tora L., van Dorsselaer A. (2003). Novel subunits of the TATA binding protein free TAFII-containing transcription complex identified by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry following one-dimensional gel electrophoresis. Proteomics. 3: 217—223. PMID 12601814 doi:10.1002/pmic.200390030

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11536 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q6P1X5 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 8

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11536 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q6P1X5 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]