FOXD4

FOXD4
Ідентифікатори
Символи	FOXD4, FKHL9, FOXD4A, FREAC-5, FREAC5, forkhead box D4
Зовнішні ІД	OMIM: 601092 MGI: 1347467 HomoloGene: 83248 GeneCards: FOXD4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК • зв'язування з ДНК • DNA binding, bending • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ДНК-матрична транскрипція • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2298	14237
Ensembl	ENSG00000170122	ENSMUSG00000051490
UniProt	Q12950	Q60688
RefSeq (мРНК)	NM_207305	NM_008022
RefSeq (білок)	NP_997188	NP_032048
Локус (UCSC)	Хр. 9: 0.12 – 0.12 Mb	Хр. 19: 24.88 – 24.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

FOXD4 (англ. Forkhead box D4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 47 309.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNLPRAERLR		STPQRSLRDS		DGEDGKIDVL		GEEEDEDEEE		AASQQFLEQS
LQPGLQVARW		GGVALPREHI		EGGGGPSDPS		EFGTEFRAPP		RSAAASEDAR
QPAKPPSSYI		ALITMAILQS		PHKRLTLSGI		CAFISDRFPY		YRRKFPAWQN
SIRHNLSLND		CFVKIPREPG		RPGKGNYWSL		DPASQDMFDN		GSFLRRRKRF
QRHQPTPGAH		LPHPFPLPAA		HAALHNPRPG		PLLGAPAPPQ		PVPGAYPNTG
PGRRPYALLH		PHPPRYLLLS		APAYAGAPKK		AEGADLATPA		PFPCCSPHLV
LSLGRRARVW		RRHREADASL		SALRVSCKGS		GERVQGLRRV		CPRPRGATAP
CSSDRQACRT		ILQQQQRHQE		EDCANGCAPT		KGAVLGGHLS		AASALLRYQA
VAEGSGLTSL		AAPLGGEGTS		PVFLVSPTPS		SLAESAGPS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Freyaldenhoven B.S., Fried C., Wielckens K. (2002). FOXD4a and FOXD4b, two new winged helix transcription factors, are expressed in human leukemia cell lines. Gene. 294: 131—140. PMID 12234674 doi:10.1016/S0378-1119(02)00702-3
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Fan Y., Newman T., Linardopoulou E., Trask B.J. (2002). Gene content and function of the ancestral chromosome fusion site in human chromosome 2q13-2q14.1 and paralogous regions. Genome Res. 12: 1663—1672. PMID 12421752 doi:10.1101/gr.338402
• Pierrou S., Hellqvist M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1994). Cloning and characterization of seven human forkhead proteins: binding site specificity and DNA bending. EMBO J. 13: 5002—5012. PMID 7957066

Див. також

• Хромосома 9