HOXC9

HOXC9
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2LP0, 2MSY
Ідентифікатори
Символи	HOXC9, HOX3, HOX3B, homeobox C9
Зовнішні ІД	OMIM: 142971 MGI: 96199 HomoloGene: 130558 GeneCards: HOXC9
Онтологія гена Молекулярна функція • специфічне до послідовності зв'язування з ДНК • зв'язування з ДНК • GO:0001948, GO:0016582 зв’язування з білками плазми • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • aggresome Біологічний процес • embryonic skeletal system morphogenesis • розвиток багатоклітинного організму • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • ДНК-матрична транскрипція • anterior/posterior pattern specification • embryonic skeletal system development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 регуляція транскрипції РНК-полімеразою II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3225	15427
Ensembl	ENSG00000180806	ENSMUSG00000036139
UniProt	P31274	P09633
RefSeq (мРНК)	NM_006897	NM_008272
RefSeq (білок)	NP_008828	NP_032298
Локус (UCSC)	Хр. 12: 53.99 – 54 Mb	Хр. 15: 102.88 – 102.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOXC9 (англ. Homeobox C9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 260 амінокислот, а молекулярна маса — 29 248.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSATGPISNY		YVDSLISHDN		EDLLASRFPA		TGAHPAAARP		SGLVPDCSDF
PSCSFAPKPA		VFSTSWAPVP		SQSSVVYHPY		GPQPHLGADT		RYMRTWLEPL
SGAVSFPSFP		AGGRHYALKP		DAYPGRRADC		GPGEGRSYPD		YMYGSPGELR
DRAPQTLPSP		EADALAGSKH		KEEKADLDPS		NPVANWIHAR		STRKKRCPYT
KYQTLELEKE		FLFNMYLTRD		RRYEVARVLN		LTERQVKIWF		QNRRMKMKKM
NKEKTDKEQS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Zhou B., Liu C., Xu Z., Zhu G. (2012). Structural basis for homeodomain recognition by the cell-cycle regulator Geminin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109: 8931—8936. PMID 22615398 doi:10.1073/pnas.1200874109

Див. також

• Хромосома 12